La homeopatía como disciplina alternativa, está sujeta a críticas, en especial, por una gran parte de la medicina tradicional, porque las características de la homeopatía no tienen nada que ver con los criterios de la medicina dominante.

Debemos establecer una frontera, dentro de lo que nosotros queremos curar, o mejorar, con la homeopatía o dicho de otra forma, que es lo que nosotros esperamos de la homeopatía en cuanto a su éxito, con los enfermos.

El verdadero éxito de la homeopatía siempre será en las enfermedades funcionales. Por eso, nosotros, como médicos, dedicados fundamentalmente, a la infancia, encontramos los mayores éxitos con los niños, porque en este terreno es donde se dan, primordialmente, las enfermedades funcionales. Eso no quiere decir que en la infancia no se desarrollen enfermedades orgánicas, pero en este caso no es que la homeopatía deje de curar o mejorar sino que su éxito no será tan espectacular. Como ya dijo Hahnemann (padre de dicha disciplina) "Los miasmas en la infancia son mas puros". En los adultos, por el contrario son mucho mas complejos, aunque también existen enfermedades funcionales, pero en tanto el ser humano entra en años dados los errores de la alimentación y los tóxicos ambientales, estaremos en el mundo de las enfermedades orgánicas. En este grupo la homeopatía puede actuar, pero es el mundo de la medicina tradicional.

Otro apartado de enfermedades son las psicológicas, en estas, estará indicado el estudio psicológico del paciente.

En nuestro centro se hace homeopatía unicista que es la que explicó Habnemann, en sus libros con todas sus experiencias. En una porción minoritaria de pacientes, donde el desarrollo de las enfermedades orgánicas son muy intensas, usamos la Homotoxicologia.